Doktorand i biofysik

Institutionen för biokemi och biofysik. SciLifeLab (SciLifeLab) är ett nationellt center för molekylära biovetenskaper med fokus på forskning inom hälsa och miljö. Centret kombinerar ledande teknisk expertis med avancerat kunnande inom translationell medicin och molekylära biovetenskaper. SciLifelab är en nationell resurs som drivs av Karolinska Institutet, KTH, Stockholms universitet och Uppsala universitet. Centret samarbetar med flera andra lärosäten.

Administrativt kommer anställningen att placeras vid Institutionen för biokemi och biofysik, Stockholms universitet. För mer information om vår verksamhet, se vår webbplats: www.dbb.su.se.

Projektbeskrivning

Dina studier på forskarnivå inom biofysik kommer att bedrivas inom projektet "Beräkningsbiofysik av asymmetriska membran".

Lipidbilager är allmänt förekommande och utgör grunden för alla biologiska membran. Omfattande forskning har visat hur lipidernas kemi påverkar de fysikaliska egenskaperna hos bilager med två kompositionsmässigt identiska lipidskikt. Celler reglerar dock membranernas egenskaper inte bara genom att producera olika typer av lipider, utan också genom att styra hur dessa lipider fördelas mellan de två lipidskikten. Som ett resultat kan biologiska membran ha skikt som skiljer sig både i lipidkomposition och i total lipidmängd. Hur dessa två typer av asymmetrier påverkar bilagrets egenskaper och protein-membraninteraktioner är mycket dåligt förstått, men avgörande för att klarlägga lipidorganisationens funktionella roller i celler.

Målet med detta projekt är att identifiera de grundläggande mekanismerna bakom hur asymmetri mellan de två lipidskikten påverkar membranets biofysikaliska egenskaper. Detta kommer att uppnås genom molekylärdynamiska simuleringar, där dynamiken hos atomistiska membranmodeller med systematiskt varierad komposition och grad av asymmetri analyseras, liksom deras interaktioner med membranproteiner. Simuleringarna kommer att genomföras med etablerade programvarupaket, medan analysen både kommer att bygga på befintliga verktyg och utveckling av nya metoder.

Arbetet kommer i hög grad att baseras på förmågan att programmera, lära sig och implementera olika angreppssätt (inklusive maskininlärningsbaserade metoder), tänka kritiskt och uppmärksamma detaljer. Det kommer även att omfatta frekventa interaktioner med experimentella samarbetspartners inom och utanför forskargruppen, för att validera de beräknade resultaten och testa hypoteser som genererats antingen in vitro eller in silico.

Behörighetskrav

För att bli antagen till forskarutbildning krävs att den sökande har grundläggande och särskild behörighet. Behörigheten ska vara uppfylld senast sista ansökningsdag.

Grundläggande behörighet, har du om du avlagt examen på avancerad nivå, eller fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng (hp), varav minst 60 hp på avancerad nivå, eller på annat sätt inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.

Särskild behörighet, för att antas till utbildning på forskarnivå i biofysik krävs, att den sökande med godkänt resultat fullgjort kurser om 90 högskolepoäng på grundläggande nivå i fysik eller kemi samt kurser på avancerad nivå inom biofysik, biokemi och/eller fysikalisk kemi, så att totalt 60 hp på avancerad nivå uppnås, varav ett självständigt arbete om 30 hp i något av ämnesområdena ska ingå.

Särskild behörighet har också den som i annan ordning inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper, vilket bedöms av examinator och/eller studierektor för utbildning på forskarnivå.

Urval

Urval bland behöriga sökande ska göras med hänsyn till deras förmåga att tillgodogöra sig utbildningen. Viktiga bedömningsgrunder är följande: förtrogenhet med teori, skicklighet inom ämnesområdet för avhandlingsarbetet, förmåga att uttrycka sig i tal och skrift på engelska och/eller svenska, analytisk förmåga, kreativitet, initiativförmåga, självständighet och samarbetsförmåga. Till grund för att bedöma hur den sökande uppfyller dessa krav används tidigare studiers relevans för ämnet, betyg på genomgångna högskolekurser (särskilt de på avancerad nivå), kvalitet och omfattning på det självständiga arbetet, referenser till personer som kan beskriva den sökandes färdigheter och intervjuer.

Antagningsordning för utbildning på forskarnivå vid Stockholms universitet

Om anställningen

Vi erbjuder en tidsbegränsad anställning som doktorand enligt 5 kap. högskoleförordningen (1993:100). Anställningstiden får inte vara längre än vad som motsvarar utbildning på forskarnivå på heltid under fyra år. Som doktorand ska du främst ägna dig åt din egen utbildning på forskarnivå, men i anställningen kan arbete med utbildning, forskning och administration ingå i begränsad omfattning (högst 20 %).

En ny anställning som doktorand gäller för högst ett år, anställningen förnyas därefter med högst två år i taget.

Stockholms universitet värnar om att vara en arbetsplats som är fri från diskriminering och ger lika rättigheter och möjligheter för alla.

Kontakt

Ytterligare information lämnas av biträdande lektor Milka Doktorova, milka.doktorova@dbb.su.se.

Allmän information angående forskarutbildningen kan fås från studierektor Andreas Barth, andreas.barth@dbb.su.se.

Ansökan

Du söker doktorandplatsen via Stockholms universitets rekryteringssystem. Bifoga personligt brev och CV samt de bilagor som efterfrågas i ansökningsformuläret. Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett i enlighet med annonsen och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag.

Anvisningar för sökande finns på webbsidan: att söka en anställning.