Doktorand i neurokemi

Institutionen för biokemi och biofysik, institutionens lokaler ligger huvudsakligen i Arrheniuslaboratorierna tillsammans med de andra kemiinstitutionerna och andra institutioner inom Naturvetenskapliga fakulteten. Närmare 270 personer, varav ungefär 60 doktorander, är för närvarande verksamma vid institutionen. Forskningen är av absolut världsklass och spänner över flera stora områden. Mer information om oss finns på: Institutionen för biokemi och biofysik.

Projektbeskrivning

Projekttitel: How Regulatory DNA and Epigenetics Rewired Human Brain Development.

Vi söker en mycket motiverad doktorand för att gå med i vårt projekt om att förstå hur mänskliga specifika genetiska och epigenetiska förändringar har format utvecklingen och funktionen hos våra hjärnor. Projektet syftar till att avslöja de molekylära mekanismer genom vilka icke-kodande regulatoriskt DNA påverkar hjärnans utveckling, evolution och bidrar till högre kognitiva förmågor. Vi kommer att använda banbrytande enkelcells- och rumslig epigenomisk teknik, kombinerat med in vitro hjärnorganoida modeller av både mänskliga och icke-mänskliga primater, för att identifiera och funktionellt karakterisera artspecifika regulatoriska element. Genom att störa dessa kandidatelement genom CRISPR-baserad genomredigering, försöker vi avslöja deras inverkan på neuronal utveckling, anslutning och aktivitet. Denna forskning har implikationer för att förstå vad som gör den mänskliga hjärnan unik, såväl som för att belysa neuroutvecklingsstörningar som autism och schizofreni.

Den framgångsrika kandidaten kommer att ingå i en dynamisk och tvärvetenskaplig miljö vid Laboratoriet för encellig epigenomik och neurobiologi, ledd av dr Marek Bartosovic vid Stockholms universitet. Vårt labb har banat väg för innovativa encelliga och rumsliga kromatinprofileringsmetoder (t.ex. scCUT&Tag, sc-nano-CUT&Tag) för att dissekera genregleringsmekanismer med oöverträffad upplösning. Vi kombinerar neurobiologi, epigenetik och beräkningsbiologi för att förstå grundläggande frågor om den utvecklande och vuxna hjärnan. Labbet har etablerat samarbeten med ledande internationella grupper som erbjuder tillgång till toppmoderna faciliteter för stamcellsodling, generering av organoider, avancerad bildbehandling och genomiska analyser. Vi främjar en samarbetande och stödjande forskningsatmosfär som uppmuntrar vetenskaplig nyfikenhet, kreativitet och professionell tillväxt.

Om du är entusiastisk över att undersöka den evolutionära genetiska grunden för mänsklig hjärnans utveckling och tycker om att arbeta i en utmanande och inspirerande forskningsmiljö, uppmuntrar vi dig att ansöka.

Behörighetskrav

För att bli antagen till forskarutbildning krävs att den sökande har grundläggande och särskild behörighet. Behörigheten ska vara uppfylld senast sista ansökningsdag.

Grundläggande behörighet, har den som avlagt examen på avancerad nivå, fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng (hp), varav minst 60 hp på avancerad nivå, eller på annat sätt inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.

Särskild behörighet, för att antas till utbildning på forskarnivå i neurokemi med molekylär neurobiologi krävs att den sökande inom utbildning på grundnivån har godkänt resultat på kurser om minst 120 hp i kemi/molekylära livsvetenskaper (Life Science) inklusive godkänd kurs på avancerad nivå i biokemi om minst 15 hp i neurokemi/kemi/molekylära livsvetenskaper och godkänt självständigt arbete, 30 hp, i neurokemi/kemi/molekylära livsvetenskaper på avancerad nivå. Särskild behörighet har också den som i annan ordning inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper, vilket bedöms av examinator och/eller studierektor för utbildning på forskarnivå.

Urval

Urval bland behöriga sökande ska göras med hänsyn till deras förmåga att tillgodogöra sig utbildningen. Viktiga bedömningsgrunder är följande: förtrogenhet med teori, skicklighet inom ämnesområdet för avhandlingsarbetet, förmåga att uttrycka sig i tal och skrift på engelska och/eller svenska, analytisk förmåga, kreativitet, initiativförmåga, självständighet och samarbetsförmåga. Till grund för att bedöma hur den sökande uppfyller dessa krav används tidigare studiers relevans för ämnet, betyg på genomgångna högskolekurser (särskilt de på avancerad nivå), kvalitet och omfattning på det självständiga arbetet, referenser till personer som kan beskriva den sökandes färdigheter och intervjuer.

Den idealiska kandidaten bör ha bakgrund inom molekylär och cellulär biologi med praktisk erfarenhet inom ett eller flera av följande områden:

• Cellkultur - särskilt mänskliga embryonala och inducerade pluripotenta stamceller.
• Hjärnorganoider eller organotypiska skivkulturer.
• Molekylär/cellbiologiska tekniker för våtlabb (t.ex. DNA/RNA/proteinarbete, vävnadssektionering, immunhistokemi, in situ hybridisering).
• Tidigare exponering för epigenetik, molekylär neurovetenskap, CRISPR/Cas9-genomredigering, bioinformatik eller encellsprofilering (scRNA-seq/scATAC-seq) skulle vara en fördel.
• Proaktivt förhållningssätt med förmågan att driva ett projekt framåt från konceptualisering och experimentplanering till datatolkning och rapportering.
• Stark analytisk och problemlösningsförmåga; förmåga att tolka data och bidra med idéer för att främja projektet.
• Utmärkt kommunikations- och lagarbetsförmåga med en fallenhet för samverkan och tvärvetenskaplig forskning.
• Ett drivande, självmotiverat tänkesätt och goda tidshanteringsförmåga, ivrig att lära och ta sig an nya utmaningar.
• Kunskaper i engelska i tal och skrift är en förutsättning.

Antagningsordning för utbildning på forskarnivå vid Stockholms universitet.

Om anställningen

Vi erbjuder en tidsbegränsad anställning som doktorand enligt 5 kap. högskoleförordningen (1993:100). Anställningstiden får inte vara längre än vad som motsvarar utbildning på forskarnivå på heltid under fyra år. Som doktorand ska du främst ägna dig åt din egen utbildning på forskarnivå, men i anställningen kan arbete med utbildning, forskning och administration ingå i begränsad omfattning (högst 20 %).

En ny anställning som doktorand gäller för högst ett år, anställningen förnyas därefter med högst två år i taget.

Stockholms universitet värnar om att vara en arbetsplats som är fri från diskriminering och ger lika rättigheter och möjligheter för alla.

Kontakt

Ytterligare information lämnas av projektledare Marek Bartosovic, marek.bartosovic@dbb.su.se.

Allmän information angående forskarutbildningen kan fås från studierektor Andreas Barth, andreas.barth@dbb.su.se.

Ansökan

Du söker doktorandplatsen via Stockholms universitets rekryteringssystem. Bifoga personligt brev och CV samt de bilagor som efterfrågas i ansökningsformuläret. Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett i enlighet med annonsen och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag.

Anvisningar för sökande finns på webbsidan: att söka en anställning.