Bioinformatiker vid NGI

Institutionen för biokemi och biofysik. SciLifeLab (SciLifeLab) är ett nationellt center för molekylära biovetenskaper med fokus på forskning inom hälsa och miljö. Centret kombinerar ledande teknisk expertis med avancerat kunnande inom translationell medicin och molekylära biovetenskaper. SciLifelab är en nationell resurs som drivs av Karolinska Institutet, KTH, Stockholms universitet och Uppsala universitet. Centret samarbetar med flera andra lärosäten. 

NGI är den största tekniska plattformen vid SciLifeLab. Det är en nationell resurs som erbjuder en infrastruktur för state-of-the-art DNA-sekvensering och SNP-genotypning till forskare i Sverige. Målsättning är att ge tillgång till de senaste metoderna inom storskalig DNA- och RNA-sekvensering och ge riktlinjer och stöd för provtagning, studiedesign, protokollval och bioinformatikanalys för att möjliggöra världsledande forskning. Mer information finner du på ngisweden.scilifelab.se.

Administrativt kommer anställningen att placeras vid Institutionen för biokemi och biofysik, Stockholms universitet. För mer information om vår verksamhet, se vår webbplats: www.dbb.su.se

Arbetsuppgifter

Vi letar efter en bioinformatiker för att gå med i vårt bioinformatikteam vid NGI, på SciLifeLab i Solna. Teamet arbetar under tre områden: Dataflöde, Analys och Systemutveckling. Den utvalda kandidaten får en varierad roll och kommer att vara delaktig i många typer av uppgifter inom dessa områden. De möjliga arbetsuppgifterna inkluderar att:

• leverera data till forskare
• utvärdera och felsöka sekvensdata
• analysera data från interna utvecklingsprojekt
• utveckla nya analysflöden
• konstruera webbapplikationer
• programvaruutveckling, till exempel för kvalitetskontroll
• automation av data- och analysflöden
• hjälp för att hålla befintliga pipelines och verktyg ”state-of-the-art”.

Kvalifikationer

Krav

• Akademisk examen inom Bioinformatik, Datavetenskap, Bioteknologi eller liknande.
• Programmeringskunskaper, främst i Python eller Javascript.
• Grundläggande kunskap inom versionskontroll, t.ex. git.
• Erfarenhet av att använda Linux / UNIX-terminal.
• Utmärkta kommunikations- och samarbetsförmåga.
• Du talar och skriver engelska obehindrat.

Meriterande

• Erfarenhet av HPC eller motsvarande datorsystem.
• Erfarenhet inom molekylär biologi.
• Erfarenhet av att hantera stora datamängder, särskilt nästa generations sekvenseringsdata (NGS).
• Erfarenhet av informationssystem för laboratorier (LIMS).
• Erfarenhet i bioinformatik eller motsvarande kompetens.
• Erfarenhet av webbapplikationsutveckling och / eller databasadministration (SQL eller noSQL).
• Erfarenhet av VueJs.                                                                                                 

Personliga egenskaper

För att lyckas och trivas i den här rollen så tror vi att du ska vara nyfiken på biologiska frågeställningar och intresserad av att lära dig nya bioinformatiska verktyg. Du bör uppskatta att jobba som en del av en grupp och ha ett strukturerat och kvalitetsmedvetet arbetssätt. Vi värdesätter en god kommunikationsförmåga i både tal och skrift. Vi kommer lägga stor vikt vid personliga egenskaper.

Om anställningen

Anställningen gäller tills vidare på heltid med sex månaders provanställning. Stockholms universitet tillämpar individuell lönesättning. Tillträde enligt överenskommelse.

Vi erbjuder

Hos oss får du dynamiken i samspelet mellan högre utbildning och forskning som gör Stockholms universitet till en spännande och kreativ miljö. Du arbetar i en internationell miljö och får förmånliga villkor.

Stockholms universitet värnar om att vara en arbetsplats som är fri från diskriminering och ger lika rättigheter och möjligheter för alla.

Kontakt

Ytterligare information lämnas av Ellen Sherwood, ellen.sherwood@scilifelab.se, eller Johannes Alneberg, johannes.alneberg@scilifelab.se.

Ansökan

Du söker anställningen via Stockholms universitets rekryteringssystem. Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag.

Anvisningar för sökande finns på webbsidan: att söka en anställning.