Doktorand i biofysik

Institutionen för biokemi och biofysik, institutionens lokaler ligger huvudsakligen i Arrheniuslaboratorierna tillsammans med de andra kemiinstitutionerna och andra institutioner inom Naturvetenskapliga fakulteten. Närmare 270 personer, varav ungefär 60 doktorander, är för närvarande verksamma vid institutionen. Forskningen är av absolut världsklass och spänner över flera stora områden. Mer information om oss finns på: Institutionen för biokemi och biofysik.

Projektbeskrivning

Dina studier på forskarnivå inom biofysik kommer att bedrivas inom projektet "Konformationellt och dynamiskt landskap av oordnade proteiner".

Det nukleära proteinet TDP-43 spelar en central roll i RNA-reglering. Felaktig lokalisering till cytoplasman är associerad med felveckade konformationer och kopplas till neurodegenerativa sjukdomar såsom ALS och FTLD. Även om relevansen av felveckad TDP-43 är tydlig, saknas fortfarande kunskap om de molekylära mekanismer som styr dess sammansättning. Detta projekt syftar till att identifiera de strukturella nyckelkomponenter som krävs för att driva och reglera vätske-vätske-fasseparation (LLPS) och amyloid självaggregation. Projektet syftar vidare till att förstå hur dessa konformationella processer är kopplade till varandra.

I Sahin-laboratoriet studerar vi de biokemiska och biofysiska mekanismer som ligger bakom bildning och övergångar mellan olika konformationer hos intrinsiskt oordnade proteiner (IDP), med relevans för både hälsa och sjukdom. IDP:er och deras olika strukturella tillstånd spelar viktiga roller i cellulär reglering och är även involverade i neurodegenerative sjukdomar. Vi söker nu en mycket motiverad doktorand till ett projekt som fokuserar på konformationella övergångar av TDP-43 under LLPS och aggregation. 

Projektet kommer att använda en integrativ biofysisk metod för att lösa de dynamiska och strukturella tillstånden hos TDP-43. Centrale metoder inkluderar, men är inte begränsade till: Fluorescensspektroskopi, absorbansspektroskopi, fluorescensmikroskopi, proteinuttryck och rening, masspektrometri (nativ, jonmobilitet och HDX).

Den framgångsrika kandidaten kommer att ingå i forskargrupperna ledda av dr Cagla Sahin och prof. Mikael Oliveberg, som har omfattande expertis inom proteinbiofysik. Forskargrupperna har särskild erfarenhet av och ett starkt intresse för dynamik och strukturer hos intrinsiskt oordnade proteiner samt deras fasseparation.

Behörighetskrav

För att bli antagen till forskarutbildning krävs att den sökande har grundläggande och särskild behörighet. Behörighetskraven måste vara uppfyllda vid den tidpunkt då den sökande antas till forskarutbildningen vid Institutionen för biokemi och biofysik.

Grundläggande behörighet har du, om du avlagt examen på avancerad nivå, eller fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng (hp), varav minst 60 hp på avancerad nivå, eller på annat sätt inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.

För särskild behörighet att antas till utbildning på forskarnivå i biofysik krävs, att den sökande med godkänt resultat fullgjort kurser om 90 högskolepoäng på grundläggande nivå i fysik eller kemi samt kurser på avancerad nivå inom biofysik, biokemi och/eller fysikalisk kemi, så att totalt 60 hp på avancerad nivå uppnås, varav ett självständigt arbete om 30 hp i något av ämnesområdena ska ingå. Särskild behörighet har också den som i annan ordning inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper, vilket bedöms av examinator och/eller studierektor för utbildning på forskarnivå.

Urval

Urval bland behöriga sökande ska göras med hänsyn till deras förmåga att tillgodogöra sig utbildningen. Viktiga bedömningsgrunder är följande: förtrogenhet med teori, skicklighet inom ämnesområdet för avhandlingsarbetet, förmåga att uttrycka sig i tal och skrift på engelska och/eller svenska, analytisk förmåga, kreativitet, initiativförmåga, självständighet och samarbetsförmåga. Till grund för att bedöma hur den sökande uppfyller dessa krav används tidigare studiers relevans för ämnet, betyg på genomgångna högskolekurser (särskilt de på avancerad nivå), kvalitet och omfattning på det självständiga arbetet, referenser till personer som kan beskriva den sökandes färdigheter och intervjuer.

Vi söker en kandidat med bakgrund inom biokemi, biofysik, strukturbiologi eller närliggande områden. Erfarenhet av proteinuttryck, rening och biofysikalisk karakterisering är meriterande. Ett starkt intresse för, och erfarenhet av, strukturell och molekylärbiologi relaterad till proteinfelveckning anses vara en fördel.

Antagningsordning för utbildning på forskarnivå vid Stockholms universitet.

Om anställningen

Vi erbjuder en tidsbegränsad anställning som doktorand enligt 5 kap. högskoleförordningen (1993:100). Anställningstiden får inte vara längre än vad som motsvarar utbildning på forskarnivå på heltid under fyra år. Som doktorand ska du främst ägna dig åt din egen utbildning på forskarnivå, men i anställningen kan arbete med utbildning, forskning och administration ingå i begränsad omfattning (högst 20 %).

En ny anställning som doktorand gäller för högst ett år, anställningen förnyas därefter med högst två år i taget.

Stockholms universitet värnar om att vara en arbetsplats som är fri från diskriminering och ger lika rättigheter och möjligheter för alla.

Kontakt

Ytterligare information lämnas av forskare Cagla Sahin, cagla.sahin@dbb.su.se.

Allmän information angående forskarutbildningen kan fås från studierektor Andreas Barth, andreas.barth@dbb.su.se.

Ansökan

Du söker doktorandplatsen via Stockholms universitets rekryteringssystem. Bifoga personligt brev och CV samt de bilagor som efterfrågas i ansökningsformuläret. Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett i enlighet med annonsen och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag.

Anvisningar för sökande finns på webbsidan: att söka en anställning.