Doktorand i biofysik

Institutionen för biokemi och biofysik. SciLifeLab (SciLifeLab) är ett nationellt center för molekylära biovetenskaper med fokus på forskning inom hälsa och miljö. Centret kombinerar ledande teknisk expertis med avancerat kunnande inom translationell medicin och molekylära biovetenskaper. SciLifelab är en nationell resurs som drivs av Karolinska Institutet, KTH, Stockholms universitet och Uppsala universitet. Centret samarbetar med flera andra lärosäten.

Administrativt kommer anställningen att placeras vid Institutionen för biokemi och biofysik, Stockholms universitet. För mer information om vår verksamhet, se vår webbplats: Institutionen för biokemi och biofysik.

Projektbeskrivning

Dina studier på forskarnivå inom biofysik kommer att bedrivas inom projektet "kryo-elektronmikroskopi av membranproteiner i naturliga membran".

Vi söker en mycket motiverad doktorand till vår världsledande, fysiskt samlokaliserade forskargrupp för membranproteiner på SciLifeLab. Även om singelpartikel-kryo-EM numera rutinmässigt når nästan atomär upplösning, har en av fältets mest utmanande flaskhalsar förskjutits till att fånga transienta (övergående) tillstånd och bevara den nativa membranmiljön. Förenklade system som detergenter och nanodiskar har nyligen visat sig kunna snedvrida konformationslandskapen, vilket innebär att lipidbiologi och membranets materialegenskaper återigen har blivit centrala faktorer för struktur och funktion.

Detta projekt kommer att fokusera på att studera ligandstyrda jonkanaler, vilka är utmärkta målproteiner som är mycket känsliga för allosteriska modulatorer och oligomersammansättning. Du kommer att använda toppmoderna kryo-EM-arbetsflöden för att rekonstruera dessa kanaler i nativ-liknande miljöer, med början i liposomer för att sedan övergå till cellhärledda membranvesiklar isolerade direkt från vävnad. Att studera membranproteiner i helt nativa lipiddubbelskikt är för närvarande en mycket dynamisk och snabbt växande forskningsfront inom strukturbiologin. Denna överbryggar avancerad provberedning, beräkningsbaserad bildklassificering av mikrografier och avancerad databearbetning för att klassificera strukturer som en funktion av miljön.

Vesikel- och liposombaserad kryo-EM medför ökad heterogenitet och kräver mer komplex inferens, och du kommer att arbeta i nära samarbete med grupper inom beräkning, dataanalys och visualisering. Tillsammans kommer ni att bidra till att utveckla och tillämpa nya metoder för att utvinna maximal signal från tätpackade och heterogena mikrografier. Ett stort fokus kommer att vara att möjliggöra strukturbestämning som en funktion av membranets form (t.ex. genom att identifiera strukturella klasser baserat på liposomens radie) samt att utveckla tekniker för att fånga in mindre membranproteiner in situ.

Vi förväntar oss att framgångsrika kandidater har utmärkta meriter inom biokemi eller biofysik, med omfattande laboratorieerfarenhet. Erfarenhet av kryo-EM är meriterande. Du kommer att arbeta i ett tvärvetenskapligt team på Science for Life Laboratory i Stockholm som drivs av stora biologiska utmaningar, med goda möjligheter att utforska nya forskningsriktningar både på den experimentella och beräkningsmässiga sidan genom samarbeten med de strategiska forskningsprogrammen DDLS och WASP.

Behörighetskrav

För att bli antagen till forskarutbildning krävs att den sökande har grundläggande och särskild behörighet. Behörighetskraven måste vara uppfyllda vid den tidpunkt då den sökande antas till forskarutbildningen vid Institutionen för biokemi och biofysik.

Grundläggande behörighet har du om du avlagt examen på avancerad nivå, eller fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng (hp), varav minst 60 hp på avancerad nivå, eller på annat sätt inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.

För särskild behörighet att antas till utbildning på forskarnivå i biofysik krävs, att den sökande med godkänt resultat fullgjort kurser om 90 högskolepoäng på grundläggande nivå i fysik eller kemi samt kurser på avancerad nivå inom biofysik, biokemi och/eller fysikalisk kemi, så att totalt 60 hp på avancerad nivå uppnås, varav ett självständigt arbete om 30 hp i något av ämnesområdena ska ingå. Särskild behörighet har också den som i annan ordning inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper, vilket bedöms av examinator och/eller studierektor för utbildning på forskarnivå.

Urval

Urval bland behöriga sökande ska göras med hänsyn till deras förmåga att tillgodogöra sig utbildningen. Viktiga bedömningsgrunder är följande: förtrogenhet med teori, skicklighet inom ämnesområdet för avhandlingsarbetet, förmåga att uttrycka sig i tal och skrift på engelska och/eller svenska, analytisk förmåga, kreativitet, initiativförmåga, självständighet och samarbetsförmåga. Till grund för att bedöma hur den sökande uppfyller dessa krav används tidigare studiers relevans för ämnet, betyg på genomgångna högskolekurser (särskilt de på avancerad nivå), kvalitet och omfattning på det självständiga arbetet, referenser till personer som kan beskriva den sökandes färdigheter och intervjuer.

Antagningsordning för utbildning på forskarnivå vid Stockholms universitet.

Om anställningen

Vi erbjuder en tidsbegränsad anställning som doktorand enligt 5 kap. högskoleförordningen (1993:100). Anställningstiden får inte vara längre än vad som motsvarar utbildning på forskarnivå på heltid under fyra år. Som doktorand ska du främst ägna dig åt din egen utbildning på forskarnivå, men i anställningen kan arbete med utbildning, forskning och administration ingå i begränsad omfattning (högst 20 %).

En ny anställning som doktorand gäller för högst ett år, anställningen förnyas därefter med högst två år i taget.

Stockholms universitet värnar om att vara en arbetsplats som är fri från diskriminering och ger lika rättigheter och möjligheter för alla.

Kontakt

Ytterligare information lämnas av professor Erik Lindahl, erik.lindahl@dbb.su.se.

Allmän information angående forskarutbildningen kan fås från studierektor Andreas Barth, andreas.barth@dbb.su.se.

Ansökan

Du söker doktorandplatsen via Stockholms universitets rekryteringssystem. Bifoga personligt brev och CV samt de bilagor som efterfrågas i ansökningsformuläret. Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett i enlighet med annonsen och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag.

Anvisningar för sökande finns på webbsidan: att söka en anställning.